Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capns2Q9D7J7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms