Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cldn23Q9D7D7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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