Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms