Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms