Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D5Q8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms