Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms