Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms