Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Efhd1Q9D4J1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms