Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam90a1bQ9D4F3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms