Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D454 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D454 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D454 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D454 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D454 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D454 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms