Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms