Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z4

Senp8, Sentrin-specific protease 8, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp8Q9D2Z4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Senp8Q9D2Z4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms