Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D2Q3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms