Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnaaf1Q9D2H9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf1Q9D2H9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms