Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms