Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Mrpl53Q9D1H8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Mrpl53Q9D1H8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Mrpl53Q9D1H8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Mrpl53Q9D1H8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Mrpl53Q9D1H8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Mrpl53Q9D1H8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Mrpl53Q9D1H8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Mrpl53Q9D1H8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mrpl53Q9D1H8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl53Q9D1H8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl53Q9D1H8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl53Q9D1H8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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