Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1lQ9D1E5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms