Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Upk1aQ9D132 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Upk1aQ9D132 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Upk1aQ9D132 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Upk1aQ9D132 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Upk1aQ9D132 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Upk1aQ9D132 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Upk1aQ9D132 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Upk1aQ9D132 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Upk1aQ9D132 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk1aQ9D132 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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