Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx17Q9D0I4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms