Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms