Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms