Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gins3Q9CY94 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms