Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms