Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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