Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx2Q9CWK8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms