Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF6

Bbs2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs2Q9CWF6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Bbs2Q9CWF6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Bbs2Q9CWF6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Bbs2Q9CWF6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Bbs2Q9CWF6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbs2Q9CWF6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms