Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVB6

Arpc2, Actin-related protein 2/3 complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc2Q9CVB6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc2Q9CVB6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms