Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MINDY3Q9CV28 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MINDY3Q9CV28 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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