Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sycp2Q9CUU3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms