Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d3Q9CSV6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms