Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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