Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms