Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CR55 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Q9CR55 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CR55 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Q9CR55 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CR55 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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