Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms