Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otub2Q9CQX0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms