Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms