Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms