Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms