Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med4Q9CQA5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Med4Q9CQA5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms