Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ubl4bQ9CQ84 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubl4bQ9CQ84 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms