Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmc1Q9CPZ8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms