Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms