Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrbp1Q99PL5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms