Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup155Q99P88 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup155Q99P88 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms