Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms