Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atoh8Q99NA2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms