Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf17Q99MV7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms