Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd1Q99MV1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms