Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1b4Q99ME6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms