Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms